1)1 M Tris-HCl (pH7.4, 7.6, 8.0) 组份浓度:1 M Tris-HCl 配制量:1 L 配制方法:
1. 称量121.1 g Tris置于1 L烧杯中。
2. 加入约800 ml的去离子水,充分搅拌溶解。 3. 按下表量加入浓盐酸调节所需要的pH值。 PH值 7.4 7.6 8.0 浓HCl 约70ml 约60ml 约42ml 4. 将溶液定容至1 L。
5. 高温高压灭菌后,室温保存。 注意:应使溶液冷却至室温后再调定pH值,因为Tris溶液的pH值随温度的变化差异很大,温度每升高1℃,溶液的pH值大约降低0.03个单位。 2)10×TE Buffer (pH7.4, 7.6, 8.0)
组份浓度:100 mM Tris-HCl, 10 mM EDTA 配制量:1 L 配制方法:
1. 量取下列溶液,置于1 L烧杯中。 1M Tris-HCl Buffer(PH7.4,7.6,8.0) 100ml 500mM EDTA(PH8.0) 20ml 2. 向烧杯中加入约800 ml的去离子水,均匀混合。 3. 将溶液定容至1 L后,高温高压灭菌。 4. 室温保存。
3)1.5 M Tris-HCl (pH8.8) 组份浓度:1.5 M Tris-HCl 配制量:1 L 配制方法:
1. 称量181.7 g Tris置于1 L烧杯中。
2. 加入约800 ml的去离子水,充分搅拌溶解。 3. 用浓盐酸调节pH值至8.8。 4. 将溶液定容至1 L。
5. 高温高压灭菌后,室温保存。 注意:应使溶液冷却至室温后再调定pH值,因为Tris溶液的pH值随温度的变化差异很大,温度每升高1℃,溶液的pH值大约降低0.03个单位。 4)3 M 醋酸钠(pH5.2) 组份浓度:3M 醋酸钠 配制量:100ml 配制方法:
1.称量40.8g NaAc·3H2O置于100-200ml烧杯中,加入月40ml的去离子水搅拌溶解 2.加入冰醋酸调节pH值至5.2 3.加去离子水将溶液定容至100ml
4高温高压灭菌后,室温保存。 5)PBS Buffer
组份浓度:137 mM NaCl, 2.7 mM KCl, 10 mM Na2HPO4, 2 mM KH2PO4 配制量:1 L 配制方法:
1. 称量下列试剂,置于1 L烧杯中。 NaCl KCl Na2HPO4 KH2PO4 8g 0.2g 1.42g 0.27g 2. 向烧杯中加入约800 ml的去离子水,充分搅拌溶解。
3. 滴加浓盐酸将pH值调节至7.4,然后加入去离子水将溶液定容至1 L。 4. 高温高压灭菌后,室温保存。
注意:上述PBS Buffer中无二价阳离子,如需要,可在配方中补充1 mM CaCl2和0.5 mM MgCl2。
6)10 M 醋酸铵
组份浓度:10 M 醋酸铵 配制量:100 ml 配制方法:
1. 称量77.1 g醋酸铵置于100~200 ml烧杯中,加入约30 ml的去离子水搅拌溶解。 2. 加去离子水将溶液定容至100 ml。 3. 使用0.22 mm滤膜过滤除菌。 4. 密封瓶口于室温保存。
注意:醋酸铵受热易分解,所以不能高温高压灭菌。 7)苯酚/氯仿/异戊醇 (25 : 24 : 1) 配制方法:
1. 说明:从核酸样品中除去蛋白质时常常使用苯酚/氯仿/异戊醇(25 : 24 : 1)。氯仿可使蛋白质变性并有助于液相与有机相的分离,而异戊醇则有助于消除抽提过程中出现的气泡。 2. 配制方法:将Tris-HCl平衡苯酚与等体积的氯仿/异戊醇(24 : 1)混合均匀后,移入棕色玻璃瓶中4℃保存。 8)10% (W/V) SDS
组份浓度:10% (W/V)SDS 配制量:100ml 配制方法:
1.称量10g高纯度的SDS置于100-200ml烧杯中,加入约80ml的去离子水,68℃加入溶解 2.滴加浓盐酸调节pH值至7.2
3.将溶液定容至100ml后,室温保存。 9)2 N NaOH
组份浓度:2 N NaOH 配制量:100 ml 配制方法:
1. 量取80 ml去离子水置于100~200 ml塑料烧杯中(NaOH溶解过程中大量放热,有可能使玻璃烧杯炸裂)。
2. 称取8 g NaOH小心地逐渐加入到烧杯中,边加边搅拌。
3. 待NaOH完全溶解后,用去离子水将溶液体积定容至100 ml。 4. 将溶液转移至塑料容器中后,室温保存。 10)2.5 N HCl
组份浓度:2.5 N HCl 配制量:100 ml 配制方法:
1. 在78.4 ml的去离子水中加入21.6 ml的浓盐酸(11.6 N),均匀混合。 2. 室温保存。 11)5 M NaCl
组份浓度:5 M NaCl 配制量:1 L 配制方法:
1. 称取292.2 g NaCl置于1 L烧杯中,加入约800 ml的去离子水后搅拌溶解。 2. 加去离子水将溶液定容至1 L后,适量分成小份。 3. 高温高压灭菌后,4℃保存。 11)20% (W/V) Glucose
组份浓度:20% (W/V) Glucose 配制量:100 ml 配制方法:
1. 称取20 g Glucose置于100~200 ml烧杯中,加入约80 ml的去离子水后,搅拌溶解。 2. 加去离子水将溶液定容至100 ml。 3. 高温高压灭菌后,4℃保存。 12)Solution I(质粒提取用)
组份浓度:25 mM Tris-HCl(pH8.0), 10 mM EDTA, 50 mM Glucose 配制量:1 L 配制方法:
1. 量取下列溶液,置于1 L烧杯中。 1M Tris-HCl(PH8.0) 25ml 0.5M EDTA(PH8.0) 20ml 20%Glucose(1.11M) 45ml dH2O 910ml 2. 高温高压灭菌后,4℃保存。 3. 使用前每50 ml的Solution I中加入2 ml的RNase A(20 mg/ml)。 13)Solution II(质粒提取用)
组份浓度:200mM NaOH,1%(W/V)SDS 配制量:500ml 配制方法:
1.量取下列溶液,置于500ml烧杯中 10% SDS 50ml 2N NaOH 50ml
2.加灭菌水定容至500ml,充分混匀
3.室温保存,此溶液保存时间最好不要超过一个月 注意:SDS易产生气泡,不要剧烈搅拌 14)Solution III(质粒提取用)
组份浓度:3 M KOAc, 5 M CH3COOH 配制量:500 ml 配制方法:
1. 称量下列试剂,置于500 ml烧杯中。 KOAc CH3COOH 147g 57.5ml 2. 加入300 ml去离子水后搅拌溶解。 3. 加去离子水将溶液定容至500 ml。 4. 高温高压灭菌后,4℃保存。 15)0.5 M EDTA(pH8.0) 组份浓度:0.5 M EDTA 配制量:1 L 配制方法:
称取186.1 g Na2EDTA·2H2O,置于1 L烧杯中。 2. 加入约800 ml的去离子水,充分搅拌。
3. 用NaOH调节pH值至8.0(约20 g NaOH)。 注意:pH值至8.0时,EDTA才能完全溶解。 4. 加去离子水将溶液定容至1 L。 5. 适量分成小份后,高温高压灭菌。 6. 室温保存。 16)1 M DTT
组份浓度:1 M DTT 配制量:20 ml 配制方法:
1. 称取3.09 g DTT,加入到50 ml塑料离心管内。
2. 加20 ml的0.01 M NaOAc(pH5.2),溶解后使用0.22 mm滤器过滤除菌。 3. 适量分成小份后,-20℃保存。 17)10 mM ATP
组份浓度:10 mM ATP 配制量:20 ml 配制方法:
1. 称取121 mg Na2ATP·3H2O,加入到50 ml塑料离心管内。 2. 加20 ml的25 mM Tris-HCl(pH8.0),搅拌溶解。 3. 适量分成小份后,-20℃保存。 一.常用贮液与溶液
1mol/L亚精胺(Spermidine): 溶解2.55g亚精胺于足量的水中,使终体积为10ml。分装成小份贮存于-20℃。
1mol/L精胺(Spermine):溶解3.48g精胺于足量的水中,使终体积为10ml。分装成小份贮存于-20℃。
10mol/L乙酸胺(ammonium acetate):将77.1g乙酸胺溶解于水中,加水定容至1L后,用0.22um孔径的滤膜过滤除菌。 10mg/ml牛血清蛋白(BSA):加100mg的牛血清蛋白(组分V或分子生物学试剂级,无DNA酶)于9.5ml水中(为减少变性,
须将蛋白加入水中,而不是将水加入蛋白),盖好盖后,轻轻摇动,直至牛血清蛋白完全溶
解为止。不要涡旋混合。加水定容到10ml,然后分装成小份贮存于-20℃。 1mol/L二硫苏糖醇(DTT):在二硫苏糖醇5g的原装瓶中加32.4ml水,分成小份贮存于-20℃。或转移100mg的二硫苏糖醇
至微量离心管,加0.65ml的水配制成1mol/L二硫苏糖醇溶液。 8mol/L乙酸钾(potassium acetate):溶解78.5g乙酸钾于足量的水中,加水定容到100ml。 1mol/L氯化钾(KCl):溶解7.46g氯化钾于足量的水中,加水定容到100ml。 3mol/L乙酸钠(sodium acetate):溶解40.8g的三水乙酸钠于约90ml水中,用冰乙酸调溶液的pH至5.2,再加水定容到100ml。
0.5mol/L EDTA:配制等摩尔的Na2EDTA和NaOH溶液(0.5mol/L),混合后形成EDTA的三钠盐。或称取186.1g的Na2EDTA·2H2O和20g的NaOH,并溶于水中,定容至1L。 1mol/L HEPES:将23.8gHEPES溶于约90ml的水中,用NaOH调pH(6.8-8.2),然后用水定容至100ml。
1mol/L HCl:加8.6ml的浓盐酸至91.4ml的水中。
25mg/ml IPGT:溶解250mg的IPGT(异丙基硫代-β-D-半乳糖苷)于10ml水中,分成小份贮存于-20℃。
1mol/LMgCl2:溶解20.3g MgCl2·6H2O于足量的水中,定容到100ml。 100mmol/L PMSF:溶解174mg的PMSF(苯甲基磺酰氟)于足量的异丙醇中,定容到10ml。分成小份并用铝箔将装液管包裹 或贮存于-20℃。
20mg/ml蛋白酶K(proteinase K):将200mg的蛋白酶L加入到9.5ml水中,轻轻摇动,直至蛋白酶K完全溶解。不要涡旋混合。加水定容到10ml,然后分装成小份贮存于-20℃。 10mg/mlRnase(无DNase)(DNase-free RNase):溶解10mg的胰蛋白RNA酶于1ml的10mmol/L的乙酸钠水溶液中(pH 5.0)。溶解后于水浴中煮沸15min,使DNA酶失活。用1mol/L的Tris-HCl调pH至7.5,于-20℃贮存。(配制过程中要戴手套) 5mol/L氯化钠(NaCl):溶解29.2g氯化钠于足量的水中,定容至100ml。 10N氢氧化钠(NaOH):溶解400g氢氧化钠颗粒于约0.9L水的烧杯中(磁力搅拌器搅拌),氢氧化钠完全溶解后用水定容至1L。 10%SDS(十二烷基硫酸钠):称取100gSDS慢慢转移到约含0.9L的水的烧杯中,用磁力搅拌器搅拌直至完全溶解。用水定容至1L。 2mol/L山梨(糖)醇(Sorbitol):溶解36.4g山梨(糖)醇于足量水中使终体积为100ml。 100%三氯乙酸(TCA):在装有500gTCA的试剂瓶中加入100ml水,用磁力搅拌器搅拌直至完全溶解。(稀释液应在临用前配制)
2.5% X-gal(5-溴-4-氯-3-吲哚-β-半乳糖苷):溶解25mg的X-gal于1ml的二甲基甲酰胺(DMF),用铝箔包裹装液管,贮存于-20℃。 100×Denhardt试剂(Denhardt's regent) 成分及终浓度 2%聚蔗糖(Ficoll,400型) 2%聚乙烯吡咯烷酮(PVP-40) 2%BSA(组分V) 水 配制100ml溶液各成分的用量 2g 2g 2g 加水至总体积为100ml 依照上表称取各组分,溶于水中定容。过滤除菌及杂质,分装成小份于-20℃贮存。 10×标准DNA连接酶缓冲液(standard DNA ligase buffer)(粘端、平端连接) 成分及终浓度 0.5mol/L Tris-HCl 配制10ml溶液各成分的用量 5ml 1mol/L 贮液 100mmol/L MgCl2 100mmol/L DTT 2mmol/L ATP 5mmol/L 盐酸亚精胺(可选) 0.5mg/ml BSA(组分V)(可选) 水 1ml 1mol/L 贮液 1ml 1mol/L 贮液 200ul 100 mmol/L 贮液 50ul 1 mmol/L 贮液 0.5ml 10 mg/mL 贮液 2.25ml
将配制好的缓冲液分装成小份,贮存于-20℃ 。 100 mmol/L dNTP 溶液(dNTP solutions)
可以购买到100mmol/L纯dNTPs贮液,-80℃可贮存至少6个月。 10mmol/L dNTP混合液 成分及终浓度 10mmol/L dATP 10mmol/L dCTP 10mmol/L dGTP 10mmol/L dTTP 水 20%PEG 8000/2.5M NaCl 成分及终浓度 配制10ml溶液各成分的用量 20g 质量浓度为20%聚乙二醇 50ml 5 mol/L 氯化钠 或 14.6g 固体氯化2.5mol/L 氯化钠 钠 水 补足100ml
加聚乙二醇于含有氯化钠的烧杯中,加水至终体积100ml,用磁力搅拌器搅拌溶解。 20×SSC 成分及终浓度 配制1L溶液各成分的用量 300mmol/L 柠檬酸三钠(二88.2g 水) 175.3g 3mol/L 氯化钠 补足1L 水
溶解柠檬酸三钠(二水)和氯化钠于约0.9L水中,加几滴10N NaOH溶液调pH为7.0,用水补足体积至1L。
DEPC(焦碳酸二乙酯)处理水
加100ul DEPC 于 100ml 水中,使DEPC的体积分数为0.1%。在37℃温浴至少12h,然后在15 psi 条件下高压灭菌20min,以使残余的DEPC失活。DEPC会与胺起反应,不可用DEPC处理Tris缓冲液。
甲酰胺(deionized formamide)
直接购买或加Dowex XG8 混合树脂于装有甲酰胺的玻璃烧杯中,用磁力搅拌器轻轻搅拌1h,可去除甲酰胺中的离子。经Whatman 1号滤纸过滤除去树脂后分成小份,充氮气于-80℃贮存(防止氧化)。
磷酸缓冲液(phosphate buffer)
按照下表所给定的体积,混合1 mol/L 的磷酸二氢钠(单碱)和1mol/L 磷酸氢二钠(双碱)
配制20ul溶液各成分的用量 2ul 100 mmol/L dATP 贮液 2ul 100 mmol/L dCTP 贮液 2ul 100 mmol/L dGTP 贮液 2ul 100 mmol/L dTTP 贮液 12ul 贮液,获得所需pH的磷酸缓冲液。配制1 mol/L 的磷酸二氢钠(NaH2PO4·H2O)贮液:溶解138g于足量水中,使终体积为1L;1mol/L 磷酸氢二钠(Na2HPO4)贮液:溶解142g于足量水中使终体积为1L。
1mol/L 磷酸二氢钠(ml) 1mol/L 磷酸氢二钠(ml) 最终 pH值 877 850 815 775 735 685 625 565 510 450 390 330 280 成分及终浓度 10mmol/L Tris-HCl 1mmol/L EDTA 水 123 150 185 225 265 315 375 435 490 550 610 670 720 6.0 6.1 6.2 6.3 6.4 6.5 6.6 6.7 6.8 6.9 7.0 7.1 7.2 配制100ml溶液各成分的用量 1ml 1mol/L Tris-HCl(pH7.4-8.0,25℃) 200ul 0.5 mol/L EDTA(pH 8.0) 98.8ml TE(用于悬浮和贮存DNA) Tris缓冲液(Tris-HCl buffer)
将121g的Tris碱溶解于约0.9L水中,再根据所要求的pH(25℃下)加一定量的浓盐酸(11.6N),用水调整终体积至1L。 浓盐酸的体积(ml) 8.6 14 21 28.5 38 46 56 66 71.3 76 二.电泳缓冲液、染料和凝胶加样液 电泳缓冲液 50×Tris-乙酸(TAE)缓冲液 成分及终浓度 2mol/L Tris碱 1mol/L 乙酸 100 mmol/L EDTA 水 配制1L溶液各成分的用量 242g 57.1 ml的冰乙酸(17.4 mol/L) 200ml的0.5 mol/L EDTA(pH 8.0) 补足1L pH 9.0 8.8 8.6 8.4 8.2 8.0 7.8 7.6 7.4 7.2 5×Tris-硼酸(TBE)缓冲液 成分及终浓度 445 mmol/L Tris碱 445 mmol/L 硼酸盐 10 mmol/L EDTA 水 配制1L溶液各成分的用量 54g 27.5g 硼酸 20 ml的0.5 mol/L EDTA(pH 8.0) 补足1L 染料
1%溴酚蓝(bromophenol blue)
加1g水溶性钠型溴酚蓝于100ml水中,搅拌或涡旋混合直到完全溶解。 1%二甲苯青FF(xylene cyanole FF)
溶解1g二甲苯青FF于足量水中,定容到100ml。 10mg/ml的溴化乙锭(ethidium bromide)
小心称取1g溴化乙锭,转移到广口瓶中,加100ml水,用磁力搅拌器搅拌直到完全溶解。用铝箔包裹装液管,于4℃贮存。 凝胶上样液(gel loading solutions) 6×碱性凝胶上样液(室温贮存) 成分及终浓度 0.3 N 氢氧化钠 6 mmol/L EDTA 18%聚蔗糖(400型) 0.15%溴甲酚绿 0.25%二甲苯青FF 水 6×聚蔗糖凝胶上样液(室温贮存) 成分及终浓度 0.15%溴酚蓝 0.15%二甲苯青FF 5 mmol/L EDTA 15%聚蔗糖(400型) 水 成分及终浓度 0.25%溴酚蓝 0.25%二甲苯青FF 15%聚蔗糖(400型) 水 6×甘油凝胶上样液(4℃贮存) 成分及终浓度 0.15%溴酚蓝 0.15%二甲苯青FF 5 mmol/L EDTA 50%甘油 水 6×蔗糖凝胶上样液(室温贮存)
配制10ml溶液各成分用量 1.5ml 1%溴酚蓝 1.5ml 1%二甲苯青FF 100ul 0.5mol/L EDTA(pH8.0) 3ml 3.9ml 配制10ml溶液各成分用量 1.5ml 1%溴酚蓝 1.5ml 1%二甲苯青FF 100ul 0.5mol/L EDTA(pH8.0) 1.5g 补足到10ml 配制10ml溶液各成分用量 2.5ml 1%溴酚蓝 2.5ml 1%二甲苯青FF 1.5g 补足到10ml 配制10ml溶液各成分用量 300ul 10N 氢氧化钠 120ul 0.5mol/L EDTA(pH8.0) 1.8g 15mg 25mg 补足到10ml 6×溴酚蓝/二甲苯青/聚蔗糖凝胶上样液(室温贮存) 成分及终浓度 0.15%溴酚蓝 0.15%二甲苯青FF 5 mmol/L EDTA 40%聚蔗糖 水 成分及终浓度 0.2%溴酚蓝 0.2%二甲苯青FF 200 mmol/L EDTA 0.1%SDS 50%甘油 水 三.常用培养基 LB培养基
将下列组分溶解在0.9L水中: 蛋白胨 酵母提取物 氯化钠 配制10ml溶液各成分用量 1.5ml 1%溴酚蓝 1.5ml 1%二甲苯青FF 100ul 0.5mol/L EDTA(pH8.0) 4g 补足到10ml 配制10ml溶液各成分用量 20mg 20mg 4ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0) 100ul 10% SDS 5ml 补足到10ml 10×十二烷基硫酸钠/甘油凝胶上样液(室温贮存) 10g 5g 10g 如果需要用1N NaOH(~1ml)调整pH至7.0,再补足水至1L。注:琼脂平板需添加琼脂粉12g/L,上层琼脂平板添加琼脂粉7g/L。 SOB培养基
将下列组分溶解在0.9L水中: 蛋白胨 酵母提取物 氯化钠 1 mol/L 氯化钾 20g 5g 0.5g 2.5ml
用水补足体积到1L。分成100ml的小份,高压灭菌。培养基冷却到室温后,再在每100ml的小份中加1ml灭过菌的1mol/L氯化镁。 SOC培养基
成分、方法同SOB培养基的配制,只是在培养基冷却到室温后,除了在每100ml的小份中加1ml灭过菌的1mol/L氯化镁外,再加2ml灭菌的1mol/L葡萄糖(18g葡萄糖溶于足够水中,再用水补足到100ml,用0.22um的滤膜过滤除菌)。 TB培养基
将下列组分溶解在0.9L水中: 蛋白胨 酵母提取物 甘油 12g 24g 4ml 各组分溶解后高压灭菌。冷却到60℃,再加100ml灭菌的170mmol/L KH2PO4/0.72 mol/L K2HPO4的溶液(2.31g的KH2PO4和12.54gK2HPO4溶在足量的水中,使终体积为100ml。高压灭菌或用0.22um的滤膜过滤除菌)。
2×YT培养基
将下列组分溶解在0.9L水中: 蛋白胨 酵母提取物 氯化钠 16g 10g 4ml 如果需要用1N NaOH(~1ml)调整pH至7.0,再补足水至1L。注:琼脂平板需添加琼脂粉12g/L,上层琼脂平板添加琼脂粉7g/L。 YPD培养基
将下列组分溶解在0.9L水中: 蛋白胨 酵母提取物 葡萄糖 20g 10g 20g 用水补足体积为1L后,高压灭菌。建议在高压灭菌之前,对色氨酸营养缺陷型每升培养基添加1.6g色氨酸,因为YPD培养基是色氨酸型培养基。为了配制平板,需要在高压灭菌前加入20g琼脂粉。 四.常用抗生素
氨苄青霉素(ampicillin)(100mg/ml)
溶解1g氨苄青霉素钠盐于足量的水中,最后定容至10ml。分装成小份于-20℃贮存。常以25ug/ml~50ug/ml的终浓度添加于生长培养基。 羧苄青霉素(carbenicillin)(50mg/ml)
溶解0.5g羧苄青霉素二钠盐于足量的水中,最后定容至10ml。分装成小份于-20℃贮存。常以25ug/ml~50ug/ml的终浓度添加于生长培养基。 甲氧西林(methicillin)(100mg/ml) 溶解1g甲氧西林钠于足量的水中,最后定容至10ml。分装成小份于-20℃贮存。常以37.5ug/ml终浓度与100ug/ml氨苄青霉素一起添加于生长培养基。 卡那霉素(kanamycin)(10mg/ml)
溶解100mg卡那霉素于足量的水中,最后定容至10ml。分装成小份于-20℃贮存。常以10ug/ml~50ug/ml的终浓度添加于生长培养基。 氯霉素(chloramphenicol)(25mg/ml)
溶解250mg氯霉素足量的无水乙醇中,最后定容至10ml。分装成小份于-20℃贮存。常以12.5ug/ml~25ug/ml的终浓度添加于生长培养基。 链霉素(streptomycin)(50mg/ml)
溶解0.5g链霉素硫酸盐于足量的无水乙醇中,最后定容至10ml。分装成小份于-20℃贮存。常以10ug/ml~50ug/ml的终浓度添加于生长培养基。 萘啶酮酸(nalidixic acid)(5mg/ml)
溶解50mg萘啶酮酸钠盐于足量的水中,最后定容至10ml。分装成小份于-20℃贮存。常以15ug/ml的终浓度添加于生长培养基。 四环素(tetracyyline)(10mg/ml)
溶解100mg四环素盐酸盐于足量的水中,或者将无碱的四环素溶于无水乙醇,定容至10ml。分装成小份用铝箔包裹装液管以免溶液见光,于-20℃贮存。常以10ug/ml~50ug/ml的终浓度添加于生长培养基。
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