1、在侦查期间，发现犯罪嫌疑人另有重要罪行的，自发现之日起重新计算羁押期限。
重新计算羁押期限的，由机关决定，不再经批准。但须报备案，并受监督。
另有重要罪行，是指与逮捕时的罪行不同种的重大犯罪和同种的将影响罪名认定、量刑档次的重大犯罪。
2、犯罪嫌疑人不讲真实姓名、住址，身份不明的，侦查羁押期限自查清其身份之日起计算，但不得停止对其的侦查取证。对于犯罪事实清楚，证据确实、充分的，也可以按其自报的姓名移送审查起诉。
3、对被羁押的犯罪嫌疑人作精神病鉴定的时间，不计入侦查羁押期限。其他鉴定时间则应当计入羁押期限。对于因鉴定时间较长，办案期限届满仍不能终结的案件，自期限届满之日起，应当对被羁押的犯罪嫌疑人变更强制措施，改为或监视居住。
一、侦查羁押期限是多长时间
对犯罪嫌疑人逮捕后的侦查羁押期限不得超过2个月。
1、案情复杂、期限届满不能终结的案件，可以经上一级批准延长1个月。
2、下列案件在上述3个月内仍不能侦查终结，经省、自治区、直辖市批准或者决定，可以再延长2个月：
（1）交通十分不便的边远地区的重大复杂案件
（2）重大的犯罪集团案件
（3）流窜作案的重大复杂案件
（4）犯罪涉及面广，困难的重大复杂案件。
3、对犯罪嫌疑人可能判处10年有期徒刑以上刑罚，在上述5个月内仍不能侦查终结，经省、自治区、直辖市批准或者决定，可以再延长2个月。
4、因为特殊原因，在较长时间内不宜交付审判的特别重大复杂的案件，由最高报请全国人民代表大会常务委员会批准延期审理。
二、羁押期限超过刑期怎么办
羁押期限超过了刑期表示为超期羁押。超期羁押指的是犯罪嫌疑人被拘留时间超过了规定的时间的情况。这是一种违法的行为，会严重侵害嫌疑人的权益，还会损害机关的形象。一般说来，超期羁押分为两种类型：一是具有事实依据的非人为故意超期的羁押，另一种是认为的，故意的超期羁押。
在我们机关办理案件的过程中，或多或少会存在着超期羁押的现象，那对于发生了这样的事情后该如何处置，有以下的办法：
1、若是因为机关没有及时处理案件而引起的超期羁押，当事人可以向机关上一级领导申诉，要求撤销之前的决定，及时的改正。
2、若是因为机关里的相干人员懈怠、办案过程不公开透明混乱不堪的，办案人员造成的超期羁押，当事人可以向机关上一级领导申诉，可以申请国家赔偿，并且给予相关执法人员处罚。
