宅基地有纠纷不能确权。
宅基地不能确权的具体如下：
1、宅基地存在争议尚未解决的不能确权；
2、新审批宅基地不可以确权；
3、买卖宅基地不能确权；
4、小产权房不能确权；
5、基本农田上盖房的不可以确权。
解决办法如下：
1、先解决纠纷，再进行确权；
2、归还老宅基地或者父母和孩子分户；
3、买卖宅基地本身不合法，不能确权；
4、小产权房不符合《中华人民共和国土地管理法》规定，不可以确权；
5、农民私自改变土地用途在基本农田上盖房的，不可以确权。
《中华人民共和国土地管理法》第十四条 土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决；协商不成的，由处理。
单位之间的争议，由县级以上处理；个人之间、个人与单位之间的争议，由乡级或者县级以上处理。
当事人对有关的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起三十日内，向人民起诉。
在土地所有权和使用权争议解决前，任何一方不得改变土地利用现状。第十七条 土地利用总体规划按照下列原则编制：
（一）落实国土空间开发保护要求，严格土地用途管制；
（二）严格保护永久基本农田，严格控制非农业建设占用农用地；
（三）提高土地节约集约利用水平；
（四）统筹安排城乡生产、生活、生态用地，满足乡村产业和基础设施用地合理需求，促进城乡融合发展；
（五）保护和改善生态环境，保障土地的可持续利用；
（六）占用耕地与开发复垦耕地数量平衡、质量相当。第十九条 县级土地利用总体规划应当划分土地利用区，明确土地用途。
乡（镇）土地利用总体规划应当划分土地利用区，根据土地使用条件，确定每一块土地的用途，并予以公告。
