校车扣分规定如下：
1、校车超员百分之五十会被机关交通管理部门扣十二分，并处五百元以上二千元以下罚款；
2、校车载人超过核定人数20%以上的一次扣12分，处二百元以上五百元以下罚款；
3、校车载人超过核定人数未达20%的，一次扣6分。
校车载人超过核定人数的，由机关交通管理部门扣留车辆至违法状态消除，并依照道路交通安全法律法规的规定从重处罚。校车驾驶人应当在每一个记分周期结束后，30日内到机关交通管理部门接受审验审验时，应当提交县级或者团级以上医疗机构出具的有关身体条件的证明，参加不少于3小时的道路，交通安全法规，法律，法规，交通安全文明驾驶应急处置等知识学习并接收交通事故案例警示教育。
法律依据：《中华人民共和国道路交通安全法》第九十二条
公路客运车辆载客超过额定乘员的，处二百元以上五百元以下罚款；超过额定乘员百分之二十或者违反规定载货的，处五百元以上二千元以下罚款。货运机动车超过核定载质量的，处二百元以上五百元以下罚款；超过核定载质量百分之三十或者违反规定载客的，处五百元以上二千元以下罚款。有前两款行为的，由机关交通管理部门扣留机动车至违法状态消除。运输单位的车辆有本条第一款、第二款规定的情形，经处罚不改的，对直接负责的主管人员处二千元以上五千元以下罚款。
