法律分析：
在刑事诉讼中，公诉人是起诉犯罪嫌疑人的人。如果公诉人在指控犯罪嫌疑人的时候违反了程序规定，被告可以提出异议并进行抗辩。在这种情况下，被告有权要求停止违反程序规定的指控程序，并要求公诉人重新起诉。
法律依据：
1.《中华人民共和国刑事诉讼法》第五十七条规定：“被告人、辩护人、法定代理人有权对起诉书提出异议，应当依法审查。”
2.《中华人民共和国刑事诉讼法》第五十规定：“被告人提出异议的，应当在开庭审理前或者开庭审理时，对异议进行审查。认为异议成立的，应当裁定停止违反程序规定的指控程序。”
3.《中华人民共和国刑事诉讼法》第六十一条规定：“公诉人在指控犯罪嫌疑人的时候，应当按照法定程序规定进行。公诉人违反程序规定的，被告人、辩护人、法定代理人有权提出抗辩。”
总的来说，在刑事诉讼中，公诉人必须按照法定程序规定进行指控。如果公诉人在指控犯罪嫌疑人的时候违反了程序规定，被告可以提出异议并进行抗辩。被告有权要求停止违反程序规定的指控程序，并要求公诉人重新起诉。
