有限责任公司设置公司的组织机构如下：
1、股东会，由全体股东组成；
2、董事会，股东董事由股东会选举，董事会中的职工代表由职工代表大会选举产生；
3、经理，由董事会决定聘任；
4、监事会，股东监事由股东会选举，监事会中的职工代表由职工代表大会选举产生。
公司的组织机构具体有：
1、股东会。即全体股权持有者组成；
2、监事会。且监事会应当包括股东代表和适当比例的公司职工代表，其中职工代表的比例不得低于三分之一；
3、董事会。
注册有限责任公司的好处如下：
1、可以避免创业者承担不必要的财务风险。因为有限责任公司股东，只需要以出资额为限承担有限责任，在法律层面上就把公司和个人的财产分开了；
2、运营成本低，机构设置少，比较适合企业的初步发展阶段，而且还有利于品牌的树立。毕竟一个好的品牌不仅会吸引风投或者大型企业进行收购，也会使得公司事业快速发展。再加上现在成熟的天使、VC，几乎都基于有限责任公司设计投资方案。直接注册有限责任公司，在未来引进投资过程中也会比较顺利。
法律依据：《中华人民共和国公司法》第三十六条
有限责任公司股东会由全体股东组成。股东会是公司的权力机构，依照本法行使职权。
第四十四条
有限责任公司设董事会，其成员为三人至十三人；但是，本法第五十条另有规定的除外。
