企事业单位排污许可制具体程序为：1、企事业单位填报网上申报信息，提交纸质排污许可证申请资料；2、环保主管部门收到申请材料后，审批并提出修改意见、审核通过后核发排污许可证；3、企事业单位自行监管企业环境管理情况，并按时提交执行报告；4、环保部门采用不定期抽查等方式依证监督执法。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国水污染防治法》第二十一条直接或者间接向水体排放工业废水和医疗污水以及其他按照规定应当取得排污许可证方可排放的废水、污水的企业事业单位和其他生产经营者，应当取得排污许可证；城镇污水集中处理设施的运营单位，也应当取得排污许可证。排污许可证应当明确排放水污染物的种类、浓度、总量和排放去向等要求。排污许可的具体办法由规定。禁止企业事业单位和其他生产经营者无排污许可证或者违反排污许可证的规定向水体排放前款规定的废水、污水。
