1、内容不同
无实体网店营业执照是指针对无实体店的纯网店用户发放的个体工商营业执照。 2009年6月15日，福建泉州发放了全国第一个无实体网店营业执照。
营业执照是工商行政管理机关发给工商企业、个体经营者的准许从事某项生产经营活动的凭证。其格式由国家工商行政管理局统一规定。
2、意义不同
较之没有登记、申领营业执照的网店主要受到的约束更多，但有了工商部门的监管，消费者会更认可，放心购买，有助于打品牌。给没有实体店铺的网店颁发营业执照，是贯彻支持海西建设中的先行先试精神，但在监管程序上也会更加严格，而且一旦发现网店超越网络交易，将重罚。
没有营业执照的工商企业或个体经营者一律不许开业，不得刻制公章、签订合同、注册商标、刊登广告，银行不予开立帐户。
3、办理不同
第一张无实体网店营业执照对于规范互联网商务环境意义重大，今后将鼓励网店主申领。如果纯网店要建实体店，需要到工商部门变更登记。
法律依据：《中华人民共和国电子商务法》
第一条 为了保障电子商务各方主体的合法权益，规范电子商务行为，维护市场秩序，促进电子商务持续健康发展，制定本法。
第二条 中华人民共和国境内的电子商务活动，适用本法。 本法所称电子商务，是指通过互联网等信息网络销售商品或者提供服务的经营活动。 法律、行规对销售商品或者提供服务有规定的，适用其规定。金融类产品和服务，利用信息网络提供新闻信息、音视频节目、出版以及文化产品等内容方面的服务，不适用本法。
第三条 国家鼓励发展电子商务新业态，创新商业模式，促进电子商务技术研发和推广应用，推进电子商务诚信体系建设，营造有利于电子商务创新发展的市场环境，充分发挥电子商务在推动高质量发展、满足人民日益增长的美好生活需要、构建开放型经济方面的重要作用。
第四条 国家平等对待线上线下商务活动，促进线上线下融合发展，各级和有关部门不得采取歧视性的措施，不得滥用行政权力排除、市场竞争。
