法律分析：事业单位自动离职发生纠纷争议的，可以协商解决，也可以请第三方居中调解，还可以向仲裁委员会申请仲裁。
法律依据：
《中华人民共和国调解法》
第二条 本法所称人民调解，是指人民调解委员会通过说服、疏导等方法，促使当事人在平等协商基础上自愿达成调解协议，解决民间纠纷的活动。
第三条 人民调解委员会调解民间纠纷，应当遵循下列原则： （一）在当事人自愿、平等的基础上进行调解； （二）不违背法律、法规和国家；（三）尊重当事人的权利，不得因调解而阻止当事人依法通过仲裁、行政、司法等途径维护自己的权利。
《中华人民共和国民事诉讼法》
第三条 人民受理公民之间、法人之间、其他组织之间以及他们相互之间因财产关系和人身关系提起的民事诉讼，适用本法的规定。
第二十三条 因合同纠纷提起的诉讼，由被告住所地或者合同履行地人民管辖。
第一百一十九条 起诉必须符合下列条件： （一）原告是与本案有直接利害关系的公民、法人和其他组织； （二）有明确的被告； （三）有具体的诉讼请求和事实、理由； （四）属于人民受理民事诉讼的范围和受诉人民管辖。
《全民所有制事业单位专业技术人员和管理人员辞职暂行规定》第 所在单位或主管部门与辞职申请人之间发生争议时，可向当地人事部门人才流动争议仲裁机构申请调解或仲裁。
